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Covid: Adaptive Biotechnologies e Microsoft lançam banco de dados ImmuneCODE

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A Adaptive Biotechnologies Corp lançou o ImmuneCODE em parceria com a Microsoft para começar a compartilhar uma das maiores e mais detalhadas visualizações da resposta imune ao COVID-19 em tempo real, com base em dados não identificados gerados a partir de milhares de amostras de sangue do COVID-19 de pacientes em todo o mundo. O banco de dados aberto contém informações detalhadas sobre o conjunto extraordinariamente diverso de células T, que reconhecem especificamente características exclusivas do vírus COVID-19, chamadas antígenos, com velocidade e escala sem precedentes.

As células T contêm um tesouro de informações que podem fornecer uma medida consistente e rastreável da resposta imune. Isso pode ajudar a diagnosticar e gerenciar o COVID-19 desde a exposição até a eliminação do vírus e, potencialmente, oferecer uma avaliação precisa da imunidade. Os dados do ImmuneCODE acelerarão os esforços globais em andamento para desenvolver melhores diagnósticos.

“Em apenas alguns meses, a Adaptive e a Microsoft pretendem gerar dados para o ImmuneCODE suficientes para mapear com precisão como o sistema imunológico adaptativo responde ao SARS-CoV-2 desde a exposição inicial até a liberação usando a nossa plataforma combinada de medicina imunológica e aprendizado de máquina, fornecendo potencialmente uma avaliação precisa da imunidade “, disse Harlan Robins , diretor científico e co-fundador da Adaptive Biotechnologies. “A escala e a precisão com as quais somos capazes de decodificar a resposta das células T ao vírus podem mudar fundamentalmente nossa capacidade de recuperar-se dessa pandemia e a maneira pela qual todos os vírus são estudados no futuro”.

Milhares de amostras de sangue de pacientes geograficamente e etnicamente desidentificadas de instituições de todo o mundo estão sendo coletadas e analisadas juntamente com amostras do ImmuneRACE (Ação de Resposta Imune a Eventos COVID-19) , o estudo prospectivo das empresas que incluiu 1.000 participantes nos EUA para decodificar como os sistemas imunológicos detectam e respondem ao vírus. Usando os recursos de aprendizado de máquina e nuvem em escala de escala elevada do Microsoft Azure, a assinatura de resposta de célula T será refinada continuamente, estendendo o número de correspondências de células T relacionadas ao COVID-19 a antígenos e associando diretamente essa assinatura de célula T a doenças e resultados.

“O sequenciamento de células T da Adaptive Biotechnologies cria um problema de aprendizado de máquina extremamente grande, mas gerenciável, e, portanto, possibilita, pela primeira vez, catalogar e compartilhar como nosso sistema imunológico adaptável responde a vírus, incluindo o novo vírus que causa COVID-19 “, disse Peter Lee , vice-presidente corporativo da Microsoft Research and Incubation. “A disponibilização desses dados gratuitamente à comunidade global de pesquisa, por meio do banco de dados ImmuneCODE, aprofundará nossa compreensão coletiva da resposta imune humana e, assim, ajudará os pesquisadores a acelerar o desenvolvimento de novos fármacos e vacinas na luta contra essa crise de saúde global”.

O papel da célula T

Embora a maioria dos esforços para analisar a resposta imune se concentre na célula B ou no próprio vírus, essa abordagem é diferente porque se concentra na célula T. As células T são os primeiros respondedores do sistema imunológico adaptativo a detectar qualquer vírus. Eles rapidamente se multiplicam e circulam no sangue para atacar o vírus, geralmente antes que os sintomas apareçam. Entre muitos outros trabalhos, as células T também recrutam células B para produzir anticorpos após cerca de uma semana ou duas para potencialmente fornecer imunidade contra infecções futuras.

Até o momento, o teste para o COVID-19 tem sido na forma de um teste viral para detectar a presença do vírus ou de um teste sorológico para detectar a presença de anticorpos para sinalizar infecção anterior. Um entendimento aprofundado da resposta das células T ao vírus COVID-19 tem uma variedade de aplicações diferentes. Esse entendimento aprofundado pode melhorar a precisão do paradigma de teste existente ou fornecer uma avaliação da imunidade. Além disso, é possível que a identificação e o rastreamento da resposta das células T possam fornecer informações sobre a gravidade da doença de um paciente, a duração de qualquer período de imunidade pós-infecção e a potencial eficácia das vacinas em desenvolvimento.

À medida que a Adaptive gera esses dados, as atualizações subsequentes do ImmuneCODE fornecerão uma imagem cada vez mais clara da resposta imune ao vírus COVID-19. Isso inclui analisar as respostas imunes de milhares de indivíduos infectados, vincular as respostas das células T a antígenos virais e resultados dos pacientes e rastrear a resposta imune. Além de disponibilizar esses dados gratuitamente, a Adaptive está conduzindo sua própria pesquisa para desenvolver um novo tipo de diagnóstico, observando especificamente a resposta das células T ao vírus COVID-19.

Sobre o ImmuneCODE

O ImmuneCODE é um banco de dados aberto que fornece uma visão detalhada em nível de população da resposta imune adaptativa ao vírus COVID-19. A Adaptive Biotechnologies e a Microsoft estão disponibilizando esses dados gratuitamente para qualquer pesquisador, órgão de saúde pública ou organização de todo o mundo para acelerar soluções para a pandemia global. O banco de dados contém informações detalhadas sobre as células T específicas do vírus, bem como os antígenos relacionados ao vírus que eles reconhecem. As respostas das células T a esses antígenos serão rastreadas em toda a população para criar uma assinatura de resposta imune usando milhares de amostras não identificadas combinadas de organizações ao redor do mundo e o ImmuneRACE, o estudo clínico virtual lançado em maio para ajudar na corrida a encontrar um solução para COVID-19.

Amostras de sangue não identificadas do ImmuneRACE, incluindo pacientes que foram ativamente infectados, recuperados ou expostos recentemente ao vírus, estão sendo coletadas pelo LabCorp, através do seu negócio de desenvolvimento de medicamentos Covance, usando um serviço de flebotomia móvel. Os receptores de células imunes dessas amostras estão sendo sequenciados usando a tecnologia da plataforma Illumina e mapeados para antígenos específicos de vírus que são confirmados pela plataforma de medicina imunológica proprietária da Adaptive para induzir uma resposta imune. Esses dados do estudo estão sendo agrupados com dados de milhares de amostras adicionais, de pacientes não identificados de muitas instituições em todo o mundo. Usando os recursos de aprendizado de máquina e nuvem em escala de escala do Microsoft Azure, a precisão da resposta imune será continuamente aprimorada e atualizada on-line em tempo real, à medida que mais amostras forem sequenciadas.

 

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